Atlas wurde 1916 gegründet und ist einer der ältesten Fußballvereine Mexikos. Atlas trägt seine Heimspiele im Estadio Jalisco in Guadalajara aus. Das Stadion hat eine bedeutende Geschichte im mexikanischen Fußball und war Austragungsort zahlreicher wichtiger Spiele, darunter auch Weltmeisterschaftsspiele. Das traditionelle Heimtrikot von Atlas besteht aus einer roten und einer schwarzen Hälfte. Atlas hat eine heftige lokale Rivalität mit Chivas de Guadalajara, bekannt als „Clásico Tapatío“. Die Spiele zwischen Atlas und Chivas gehören zu den intensivsten und am meisten erwarteten Begegnungen im mexikanischen Fußball.